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空间组学样本制备攻略 骨髓安排样本怎样制备?

发布时间:   作者: 安博全站app下载安装最新版-案例
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  这份骨髓安排空转制备试验流程攻略来救场,逐过程拆解要害操作,让您的研讨少走弯路!

  (1)样本收集骨髓安排 “新鲜度” 是 RNA 质量的要害,样本离体后需 30 分钟内完结固定,根绝 RNA 降解!小鼠样本需取股骨、胫骨等部位,沿冠状面或矢状面切开以露出骨髓;人骨髓安排样本则要侧重重视安排厚度,避免影响固定液浸透作用。

  (2)固定环节引荐运用 4% 多聚甲醛做固定,其纯度高、布景信号低,不只能削减安排缩短,对脂肪和各类酶的固定作用也更优,特别适配免疫荧光、荧光原位杂交等精密试验。

  特别留意:固定后需用流水冲刷过夜,完全去除残留固定液,为后续操作扫除搅扰。

  (3)脱钙处理骨髓安排含钙化成分,脱钙是成功切片的根底,主张选用 0.5M EDTA(pH7.5)温文脱钙,4℃条件下结合磁力拌和或摇床处理 3-14 天,期间每 2-3 天替换一次脱钙液。脱钙结尾判别:用尖镊子或针尖轻戳安排,若能轻松扎透或安排显着变软,即可中止脱钙,避免过度处理损害安排。

  (4)脱水与包埋脱水过程需用梯度乙醇(50%-100%)逐渐处理,其间 70% 乙醇可在 4℃下过夜;95%、100% 等高浓度乙醇则需严厉把控处理时刻,避免安排变脆影响后续切片。包埋时按惯例白腊包埋流程操作,但要分外留意骨髓安排的摆放方向,保证切片时能完好露出方针研讨区域。

  (1)切片厚度骨髓安排切片易脱片,主张将厚度控制在 4μm(惯例 FFPE 样本多为 5μm),既能下降脱片危险,又能保证基因捕获功率,统筹试验稳定性与数据质量。

  DV200界说:以长度>200 核苷酸的 RNA 片段占比来衡量,可直观反映 RNA 的完好程度。规范:合格线%,一旦低于该数值,后续试验主张暂停或从头制备样本。

  “优先看护 RNA”:从固定到脱钙的全流程,都要把削减 RNA 损害放在第一位,DV200 作为中心方针,有必要严厉把控;

  脱片问题重道破:切片厚度、防脱载玻片选择、操作时的轻柔程度,这一些细节是保证数据完好的要害;

  流程调整要灵敏:根据样本类型(小鼠 / 人)、试验方针(惯例检测 / 精密剖析)适配办法,别生搬硬套模板。

  骨髓安排空间转录组试验虽有应战,但吃透这些流程和技巧,就能让研讨事半功倍!保藏这份攻略,下次试验直接照着操作,用高质量数据为你的科研加分!

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